動植物ローパス全ゲノムシーケンス解析
動植物のローパス全ゲノムシーケンシングは、従来ジェノタイピングアレイなどのレガシーテクノロジーを使用していた大規模なゲノミクスプロジェクトに、より包括的で正確かつ効率的なツールを提供します。lpWGSアプローチは、桁違いに多くのデータ、より大きな統計的検出力、強化されたバリアント検出機能を提供することにより、アレイを凌駕します。
動植物のローパス全ゲノムシーケンシングは、従来ジェノタイピングアレイなどのレガシーテクノロジーを使用していた大規模なゲノミクスプロジェクトに、より包括的で正確かつ効率的なツールを提供します。lpWGSアプローチは、桁違いに多くのデータ、より大きな統計的検出力、強化されたバリアント検出機能を提供することにより、アレイを凌駕します。
動植物のローパス全ゲノムシーケンシング(lpWGS)には、低いシーケンシング深度での植物・動物種のゲノム全体のシーケンシングが含まれます。
シーケンシングによるジェノタイピング(GBS)は、植物または動物のゲノム研究でよく使われる手法の一つです。費用対効果は高いものの、GBSアプローチはしばしばデータの欠損につながり、複雑なバイオインフォマティクス分析を必要とします。
当社のエンドツーエンドのワークフローは、ウシ、ブタ、イヌ、ネコ、ラット、マウス、トウモロコシ、米、大豆、エンドウなど、幅広い種についてお客様をサポートできます。また、カスタムプロジェクトについてはケースバイケースで評価した上でお引き受けしています。弊社では、選択された数の個体に対してディープシーケンシングを実行し、インピュテーションのために組み立てられたリファレンスゲノムを構築することができます。
サンプル要件
通常サンプル
- インタクトなゲノムDNA: ≥ 1μg
- 濃度:≥12.5ng/μL
- ボリューム:15μL
微量サンプル
- インタクトなゲノムDNA: ≥ 200ng
- 濃度:≥ 2.5ng/μL
- ボリューム:15μL
サービス概要
・PCRおよびPCRフリーのライブラリーが利用可能
・10bp/150bpペアエンドシーケンシング
・Q30≥80%
納品
・ QC合格から約5週間
・ ラピートサービスが提供可能
BGIの動植物ローパス全ゲノムシーケンス解析サービスは、DNBSEQ™シーケンス技術プラットフォームで実施され、業界最低水準のコストで優れたシーケンスデータを得ることができます。DNBSEQ™はシリコンバレーにあるBGIの子会社Complete Genomicsが開発した独自のシーケンシング技術であり、増幅エラー率が低く、重複率が非常に低いという点で優位性を持っています。さらに、DNBSEQ™プラットフォームのインデックスホッピング率は、他のプラットフォームと比べてはるかに低いことが研究により示されています。
お客様のプロジェクトの詳細やお見積りのご希望がございましたら、お気軽にお問い合わせください。
その他のシーケンシングリソースへのアクセス
プロジェクト開始から結果報告まで、お客様のサンプルを大切に取り扱います。経験豊富なラボの専門家は、厳格な品質手順に従い、結果の完全性を確保します。
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