動植物de novoシーケンス解析
BGIは de novo 全ゲノムシーケンシングのリーダーとして認められており、400種以上のゲノムの de novo シーケンシングとアセンブリングにおいて豊富な経験を有しています。ご質問やお見積もりの請求は、お気軽にお問い合わせください。
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De Novoシーケンス解析の紹介
De Novo シーケンス解析とは、参照配列のない新規ゲノムのシーケンシングのことです。De Novo シーケンス解析のプロセスには、小さな／大きなDNA断片のシーケンシング、リードをより長い配列（コンティグ）にアセンブリし、最後にコンティグを並べて全ゲノム配列を取得することが含まれています。
BGIは20年以上にわたりde novo全ゲノムシーケンシングを提供しており、世界主要のジャーナルに多種多様なサンプル種にまたがる数多くのde novoゲノムを発表してきました。
当社は、お客様のプロジェクトを成功に導くために、de novoシーケンシングプロジェクトをサポートするための一連の技術に加え、最適なシーケンシングおよびバイオインフォマティクスのオプションの計画に関する専門家の支援を提供します。
動植物de novoシーケンス解析 - BGIサービス概要
サンプル要件
※技術チラシを参照
サービス仕様
・ライブラリー作製（DNBSEQ™/Illumina、Nanopore PromethION、PacBio Sequel IIなど）
・Q20≥90%
・リード>20Kb、Nanopore passデータ≧100Gb
・リードN50>20kb、PacBio Sequel II CLRデータ≧100Gb
・PacBio Sequel II CCS（HiFiライブラリー）データ≧20Gb、精度99%以上
納品
・QC合格から約8週間
・コモンゲノムアセンブリおよびコンプレックスゲノムアセンブリのバイオインフォマティクスはそれぞれQC合格から8週間と14週間
・ゲノムアノテーションのバイオインフォマティクスはQC合格から約6週間
・生物種のゲノムサイズ＞5Gbの場合はお問い合わせください
De Novoシーケンシング技術
BGIの動植物de novo シーケンス解析サービスは、当社のDNBSEQ™テクノロジーNGSプラットフォームに加え、Nanopore PromethION、PacBio Sequel II、Hi-Cプラットフォームなど、利用可能なプラットフォームを組み合わせて、シーケンシング、ライブラリー作製、マッピングを行います。さらに、BGIはゲノムアセンブリ、アノテーション、進化研究のための広範なバイオインフォマティクスデータ解析オプションを提供することが出来ます。
クリーンデータ出力に加えて、BGIはお客様の動植物de novoシーケンスプロジェクト向けにゲノム調査、遺伝子アノテーション、進化解析、補助アセンブリなどを含む標準およびカスタマイズされたバイオインフォマティクスパイプラインを提供します。
お客様のプロジェクトの詳細やお見積りのご希望がございましたら、お気軽にお問い合わせください。
その他のシーケンシングリソースへのアクセス
プロジェクト開始から結果報告まで、お客様のサンプルを大切に取り扱います。経験豊富なラボの専門家は、厳格な品質手順に従い、結果の完全性を確保します。
リソース
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