革新突破!CycloneSEQ重塑地贫基因检测新格局
2024-10-18
地中海贫血(简称“地贫”) ,是一种由于珠蛋白基因突变而引起的遗传性血液疾病[1]。在中国,约有3,000万人携带地贫基因,其中约30万为中重度患者。地贫患者的出生给社会和家庭带来了沉重的经济负担,以重型β地贫为例,患者需要定期输血和铁剂治疗,终生治疗费用可高达480万元[2],是导致家庭经济困难的重要原因之一。
国内外经验表明,预防是控制地贫的关键。婚前、孕前和产前地贫防控计划,通过基因检测发现人群中同型地贫基因携带高风险夫妇,经遗传咨询和必要的产前诊断可以避免地贫患儿出生。
秉承“基因科技造福人类”愿景,华大基因始终坚持自主创新,致力于地中海贫血的防治工作。2013年,华大基因在全球推出了基于高通量测序技术的地中海贫血基因检测产品,经过多年的临床实践,证实了该技术在地贫防控中的显著效果。2024年9月9日,华大面向全球发布了最新测序技术——CycloneSEQ测序技术,两款拥有自主产权的新型基因测序仪——纳米孔测序仪CycloneSEQ-WT02 (中文名“梧桐”)、CycloneSEQ-WY01 (中文名“五岳”) 。这些技术在单芯片孔道蛋白数量、测序速度、读长和准确率等关键指标上表现出色。
为了进一步优化地贫防控和临床服务,华大基因正式推出了基于CycloneSEQ平台的地中海贫血基因检测新产品。这些产品旨在满足不同临床场景下的基因检测需求,帮助医疗机构快速获得精确的检测结果,提高诊疗效率,并进一步增强地贫防控的效果。
1 产品介绍
基于自主知识产权的Index标签引物采用Long-range PCR对α和β珠蛋白基因进行靶向扩增,实现多样本的混合建库和测序。针对靶向扩增子开发相匹配的生物信息分析流程,实现地贫各种CNV和SNV自动化结果判断。
2 产品信息
DX2350地中海贫血基因检测 (纳米孔单分子测序)
3 适用人群
⦿ 地贫高发地区人群,包括婚孕前、产前和新生儿人群;
⦿ 有地贫家族遗传史、临床典型表征及常规筛查异常的人群;
⦿ 常规地贫基因检测未检出,怀疑有罕见地贫变异人群。
4 样本要求
全血≥1 mL
5 产品优势
⦿ 技术突破:CycloneSEQ测序技术在核心技术和关键组件上实现突破,特别是在单芯片孔道蛋白数量、测序速度、测序读长和准确率等关键指标上表现卓越,彰显了其在测序领域的地位。
⦿ 全面性:CycloneSEQ测序平台能够检测600多种致病性明确的地贫变异和1,000多种异常血红蛋白变异,为临床提供全面的诊断依据。
⦿ 准确性:通过CycloneSEQ测序平台对来自全球超过130种的地贫变异类型样本进行了检测,结果一致性为100%,可精准检测HKαα、antiHKαα、α珠蛋白三联体和顺反式突变的区分。
⦿ 本地化检测:CycloneSEQ平台支持本地化检测,提供科研检测服务,使得检测更便捷和快速。
救助地贫患儿,我们一直在行动
- 2008年 华大基因承担深圳市盐田区人群地贫基因筛查任务,正式开启华大的地贫防治之路。
- 2010年 华大基因率先在国内进行地贫高通量测序检测新技术的研发,同年与深圳市红十字会共同发起地中海贫血救助活动。
- 2013年 华大基因在全球推出了基于高通量测序技术的地中海贫血基因检测产品。
- 2014年 华大基因研发的地贫基因检测技术获专利,高通量基因测序技术开始在临床应用试点,同年启动面向地中海贫血患者的“春叔计划”,为100个地贫家庭提供HLA配型。
- 2016年 开展国际地贫日主题公益活动,为超过600个深圳、海南地区的重型地贫家庭提供HLA高分辨配型服务,并宣布永久免费为全球重型地贫家庭提供HLA配型服务,并在此后的8年中于广东、广西、云南、福建、湖北、湖南等地贫高发地区持续开展地贫防控相关的公益活动。
- 2017年 华大基因与深圳市广电公益基金会合作成立“华基金”,开始免费为全国重型地贫家庭提供HLA配型,截至2024年9月共收到并完成重症地贫公益样本21,517例,惠及7,237个家庭,其中784个患儿成功找到全相合供者,帮助近60名地贫患儿成功接受造血干细胞移植手术。
- 2019年 华大基因地贫高通量测序项目顺利通过广东省临检中心LDTs评审。
- 2021年 华大地贫基因治疗第一例自体干细胞完成回输,地贫基因检测技术荣获中国专利优秀奖,发布《防控全球血红蛋白病》宣言,并于同年地贫高通量测序项目累计检测样本量突破1,000,000例。
- 2022年 第十五个国际罕见病日,华大地贫防控专项宣布正式成立“天下无贫”公益专项,对地中海贫血、镰刀型贫血等血红蛋白病进行防治救助,同年,华大基因获全球首个基于高通量测序技术的地贫基因检测试剂盒获医疗器械注册证。
- 2024年 中国首个地中海贫血单分子检测多中心研究正式启动、华大研发HGI-001注射液治疗输血依赖型β地中海贫血注册Ⅰ期临床研究已获批,目前正在筹备开展注册临床试验。
结语
CycloneSEQ测序平台在地贫基因检测领域的应用,不仅提升了检测的准确性和效率,也为地贫的防控和治疗提供了新的视角和解决方案。随着技术的不断进步和应用的深入,我们有理由相信,CycloneSEQ测序平台将在地贫防控领域发挥更大的作用,为全球地贫防控贡献中国智慧和中国力量。
参考资料
[1] Taher AT, Weatherall DJ, Cappellini MD. Thalassaemia. Lancet. 2018;391(10116):155-167.
[2] 北京天使妈妈慈善基金会,北京师范大学中国公益研究院.中国地中海贫血蓝皮书-中国地中海贫血防治状况调查报告(2020)[R]。北京:中国社会出版社,2021。
[3] Goonasekera HW, Paththinige CS, Dissanayake VHW. Population Screening for Hemoglobinopathies. Annu Rev Genomics Hum Genet. 2018;19:355-380.
[4] Petrou M. Informed Choice in a Multicultural World. Thalassemia Reports. 2018; 8(1):7475.
[5] Jia-Yuan Zhang,Xiumei Lin,etc.A SINGLE-MOLECULE NANOPORE SEQUENCING PLATFORM.August 9, 2024
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