重磅来袭!基于DNBSEQ-G99平台的PMseq®病原微生物高通量基因检测正式发布!

2023-12-04

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感染性疾病是指由病原微生物(包括细菌、病毒、真菌、寄生虫等)侵入人体所引起的局部或全身性炎症或器官功能障碍。《2019世界卫生统计报告》显示:感染是造成人类死亡的重要因素,全球因感染性疾病死亡人数达610万,约占全球每年总体死亡率的11%[1],严重威胁着人类健康。

当今社会疑难危重感染与日俱增、新发/罕见病原体层出不穷、多重耐药亟待解决,快速准确鉴定病原体、指导临床靶向用药是临床早期精准诊疗、控制疾病蔓延和降低医疗负担的关键。

近年来,随着测序技术的快速发展,基于宏基因组学测序技术(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)越来越多的应用于临床感染诊断。该技术不依赖培养,直接提取临床样本中的全部核酸进行高通量测序,一次性检测上万种病原体,并可对相关耐药和毒力基因进行提示;可直接对各种已知、未知、混合感染病原微生物进行检测,打破了传统微生物检验的局限性,在临床微生物领域展现了广阔的前景[2]。

华大基因作为中国基因行业的奠基者,多年来致力于提供包括传感染疾病防控在内的多领域相关检测服务,实现全方位全生命周期的健康管理。作为宏基因组测序技术的开创者,华大基因依托自主测序平台、核心实验技术和生物信息算法,凭借PMseq®病原微生物高通量基因检测主力产品迅速占据市场,并积极加大该检测服务的入院布局,旨在解决临床疑难危重感染性疾病病原检测困难、阳性率低、检测周期长的难题,以实现感染病原的快速精准诊断。截至2023年6月30日,PMseq®系列产品累计为超过 27 万人提供检测。

临床对mNGS技术在感染性疾病诊断应用的时效性提出了更高要求,如何快速、全面、准确地鉴别病原体,是临床医生及时、有针对性地采取治疗措施的前提。华大基因基于 DNBSEQ-G99 测序仪开发的PMseq®极速病原体精准检测产品,可以进一步缩短临床急性感染病例的诊断时间,快速鉴定感染病原体,以便及时实施更精准的治疗措施,提高患者的治疗效果和生存率。

基于DNBSEQ-G99平台的PMseq®病原微生物高通量基因检测产品

本产品采用自动化样本制备系统MGISP-100提取临床疑似感染标本中全部核酸并构建测序文库,在华大自主极速中小通量DNBSEQ-G99测序平台上进行测序获得序列信息,通过本地HALOS PMseq 基因数据分析一体机,基于临床级别PMDB微生物数据库进行比对与智能化算法分析,无偏性检测17500种病原体,以及代表性耐药和毒力基因,显著提高病原诊断阳性率,指导临床靶向用药,协助感染的精准诊疗。TAT低至8-10小时,一站式轻松在本地实现从样本到分析报告的全流程。

优势1 | 极致的测序速度

“PMseq®病原微生物高通量基因检测”产品在相同测序读长(SE50)的情况下,MGISEQ-2000平台的测序时间需要12-15h,MGISEQ-200平台需要7-9h,而DNBSEQ-G99仅需3h(SE100试剂,实测SE50读长),将测序效率提升到极致。全流程TAT缩短至8-10h,大大地降低了等待时间,以便医生快速针对用药,提高诊治效率,进而挽救急危重症感染患者生命。

优势2 | 灵活的样本通量

“PMseq®病原微生物高通量基因检测”产品在DNBSEQ-G99平台上,可以根据临床实际样本量情况灵活上机检测。单次运行单张载片支持1-4例样本,若两张载片同时运行,最大可一次检测8例样本。减少凑样等待时间,随到随检,能够满足中小型医疗检测机构每日开机通量需求。

优势3 | 兼容多项目同时检测

DNBSEQ-G99平台双载片相互独立,支持单载片上机、双载片同时上机、双载片滚动上机,以及混合读长的双载片混动上机测序等多种测序模式。除了“PMseq®病原微生物高通量基因检测”以外,还可扩展病原靶向测序(tNGS)、地贫血基因检测、遗传性耳聋基因检测、肿瘤的“五癌共检”靶向用药基因检测、HPV分型基因检测等项目检测。临床可根据检测项目需求及样本量情况灵活上机,极大地提高了仪器利用率。

优势4 | 极简的测序操作

DNBSEQ-G99配备了超简易的卡式载片,一插即可开始测序。同时,测序试剂盒上采用试剂预制设计,一步按压即可完成测序试剂的配制。G99的清洗试剂盒和测序试剂盒一体化,进一步简化了操作环节。此外,操作界面智能交互,可以实时掌握测序进度。“PMseq®病原微生物高通量基因检测”产品在DNBSEQ-G99测序平台上的运行简单便捷,方便实验人员操作,利于本地化开展。

结 语

秉承“基因科技造福人类”愿景,华大基因坚持自主创新,基于全新的DNBSEQ-G99平台,为精准感染防控提供更灵活、快速、便捷的临床解决方案,助力实现感染病原的快速精准诊断。华大基因PMseq®病原微生物测序专家系统将持续推进优化升级,助力医院本地化一站式轻松检测,让病原宏基因组测序简单易用!

参考文献:

[1]《2019世界卫生统计报告》(World Health Statistics 2019)

[2] 张文宏等. 中国宏基因组二代测序检测感染病原体的临床应用专家共识. 中华传染病杂志,2020, 38(11): 681-689.

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